学校源于1905年成立的江西高等农业学堂，历经国立中正大学，江西共产主义劳动大学等时期。1962年成为江西第一个研究生培养单位，获得了江西首个“中国优秀博士学位论文提名奖”，培育了江西第一个超级稻新品种。1978年成为江西第一所全国重点大学，创建了江西第一个省部共建国家重点实验室培育基地，实行中央与地方共建、省部共管体制。学校是江西最早对外开放的单位之一、具有招收留学生资格，与纽卡斯尔大学、埃塞克斯大学等国际名校开展交换生以及合作培养项目。产生了江西第一个本土培养的中国科学院院士——黄路生教授。2012年，江农正式步入省部共建大学行列。
自2007年起，学校连续5年包揽省内非211高校“国家留学基金委国家公派研究生项目资助”名额，是江西省五所承担中国政府奖学金生培养任务院校之一，被江西省列为四所核心建设重点大学，素有“村官大学”之美誉。作为教育部中西部高校基础能力建设工程高校（又称中西部100所），是继985工程、211工程之后，国家第三阶梯大学行列，将得到国家财政和教育资源的全面大力支持与优先配给。
学校于2012年开始，农学、园艺、植物保护、林学、园林、风景园林、城乡规划、动物科学、动物医学、动物药学、农林经济管理、经济学、工商管理、金融学、财务管理、国际经济与贸易、生物工程、食品科学与工程、食品质量与安全、土木工程、农业机械化及其自动化、土地资源管理等22个专业在江西省陆续恢复一本批次招生 ，并对本科第一批录取学生实施入学奖学金和优先免试攻读学校硕士研究生等优惠政策。截至2013年，学校建有1个教育部重点建设的中国职业教育师资培训基地，2个国家级实验教学示范中心（1、植物生产实验教学示范中心2、动物生产与疾病防控实验教学中心），7个省级实验教学示范中心，1个江西省高校人文社科重点研究基地，1个江西省软科学研究基地。有婺源茶校教学点（园艺、旅游管理专业教学点），北京、上海实训教学点（软件工程专业实训教学点）。
2011年，学校的“猪牛羊良种培育及高效扩繁协同创新中心”成为江西首个“2011协同创新中心”，2012年，学校作为重点参与单位所成立的“南方稻田作物多熟制现代化生产协同创新中心”入选首批国家“2011计划”。2013年，上官新晨教授负责的食品科学与工程专业获批江西省“卓越工程师教育培养计划”项目，学校的生物工程专业成功跻身国家实力第一梯队。2013年学校新增一个博士后科研工作站“江西省农产品加工与安全控制工程实验室”。12月，江农率先在全省获批建设全国高等院校新农村发展研究院。2012年度学校获得国家留学基金委各类项目总人数达到20人，其中面上项目5人、地方合作项目6人、青骨项目8人及其它项目1人。2012年江西省高校校园文化建设优秀成果评选活动揭晓，学校报送的《构建农科类大学生“金字塔模型”校园文化建设体系的探索与实践》荣获一等奖，《培育励志助学文化，打造学生精神家 园》获得三等奖。
2013年1月，动科院与奉新永辉生态养殖有限公司签订合作协议共同成立动科院第八个校外实践教学基地——“江西农业大学奉新永辉实践教学基地”。同月，学校蔡海生教授荣获共青团中央第九届中国青年志愿者优秀个人奖。该奖项是由共青团中央、中国青年志愿者协会授予的中国青年志愿服务领域的最高荣誉。学校作物栽培学与耕作学博士学位授权点学科成功入选井冈学者特聘教授岗位学科。这也是学校继“动物遗传育种与繁殖”之后入选井冈学者特聘教授岗位的又一学科。8月，外语教学与研究出版社组织的中国高等学校大学英语教学研修班在西安举办，学校外国语学院教师杨茜希荣获示范课教学一等奖。此次研修班共有中国160所左右本科院校近800名大学英语教师参加，40多名教师做了示范教学比赛，共评出示范课一等奖5名。
